Program Pascasarjana S2 Terapan Teknologi Rekayasa di PENS mencetak para ahli di Bidang Teknologi Rekayasa melalui 2 program studi:
Teknik Elektro, dengan keahlian di bidang rekayasa elektro dan elektronika, yang mengintegrasikan desain dan fungsi untuk menciptakan inovasi produk.
Teknik Informatika dan Komputer, dengan keahlian di bidang rekayasa, pemodelan informasi dan teknologi komputasi.